Pawlikowski lớn lên theo đạo Công giáo và hiện tại vẫn vậy, nhưng nhận xét rằng ông thấy Giáo hội Công giáo ở Anh dễ phát triển đức tin hơn ở Ba Lan.[2][3]

Pawlikowski là Nghiên cứu sinh Nghệ thuật Sáng tạo tại Đại học Oxford Brookes từ năm 2004 đến năm 2007. Ông dạy đạo diễn phim và biên kịch tại Trường Điện ảnh Quốc gia ở Anh và Trường Điện ảnh Wajda ở Warszawa. Ngoài tiếng Ba Lan là tiếng mẹ đẻ của mình, ông còn nói được sáu thứ tiếng bao gồm tiếng Đức và tiếng Nga.   

Vợ của Pawlikowski phát bệnh nặng vào năm 2006 và qua đời vài tháng sau đó. Họ có một con trai và một con gái. Sau khi các con đi học đại học, Pawlikowski chuyển đến Paris và sau đó chuyển đến Warszawa, nơi ông sống gần ngôi nhà thời thơ ấu của mình.[15] Cuối năm 2017, ông kết hôn với người mẫu kiêm diễn viên Ba Lan Małgosia Bela.